阴阳学说是一种朴素的辨证唯物哲学思想。古代医学家借用阴阳五行学说来解释人体生理、病理的各种现象，并用以指导总结医学知识和临床经验，这就逐渐形成了以阴阳五行学说为基础的中医理论体系。所以阴阳学说乃是中医学基本知识，二者之间有分不开划不断的密切联系。

阴阳学说的中医应用具体可表现为以下五个方面：

一、说明人体的病理变化　

中医学认为疾病的发生，是人体的阴阳关系由于某种因素之影响而失去相对的平衡协调，从而出现偏盛偏衰的结果。疾病的发生、发展，关系到邪正两方面，正气与邪气，以及它们相互作用、相互斗争的关系，都可以用阴阳来予以概括说明。

二、说明人体的组织结构

阴阳学说在阐释人体的组织结构时，认为人体是一个对立统一的有机整体，其组织结构可划分为相互对立的阴阳两部分，且又彼此相互联系，密切合作。
首先，就人体的部位与结构来说，外为阳，内为阴；背为阳，腹为阴；头为阳，足为阴；体表为阳，内脏为阴。

应当指出，人体各部位、各组织结构、各脏器之阴阳属性不是绝对的，而是相对的，它们常根据一定条件的改变而改变。

三、说明人体的生理功能

中医生理学认为，人体正常的生命活动，是阴阳两方面对立统一协调平衡的结果。人体的生理功能，一方面表现为机体防御邪气侵袭的整体卫外功能，另一方面则表现为脏腑组织的功能活动。
从机体的防御机制来说，阳在外，为保护人体内部组织器官的卫外机能；阴在内，则为阳的物质基础，并为阳不断地储备和提供能量补充。
从脏腑功能活动来说，则五脏主藏精气为阴，六腑能消化、传导饮食水谷为阳。

对于人体整体生理上的阴阳关系，则主要强调其协调和平衡。

四、用于疾病的诊断

阴阳失调是病理变化的关键所在，故临床病证可概括为阴证、阳证两大类。所以，临床上对于疾病的诊察，亦可以根据阴阳变化的规律来加以分析和辨别。中医诊断学之望、闻、问、切四诊方法，首先当辨别阴阳。

五、指导临床治疗用药

由于阴阳的偏盛偏衰是疾病发生、发展的根本原因，所以，调理阴阳，补偏救弊，使失调的阴阳关系恢复相对平衡，这就是中医治疗学的基本原则。　　
由于病证不一，本质不同，故其治疗方法亦多种多样。中医临床根据协调阴阳的精神，提出了"寒者热之"、"热者寒之"、"虚则补之"、"实则泻之"以及"阳病治阴，阴病治阳"等众多的治疗方法。

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